Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VapbQ9QY76 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VapbQ9QY76 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VapbQ9QY76 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VapbQ9QY76 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VapbQ9QY76 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VapbQ9QY76 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VapbQ9QY76 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VapbQ9QY76 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VapbQ9QY76 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VapbQ9QY76 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VapbQ9QY76 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
VapbQ9QY76 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VapbQ9QY76 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VapbQ9QY76 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VapbQ9QY76 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VapbQ9QY76 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VapbQ9QY76 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VapbQ9QY76 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VapbQ9QY76 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VapbQ9QY76 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms