Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdcQ9QW08 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdcQ9QW08 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms