Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ap3m1Q9JKC8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms