Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ0

Cml1, Probable N-acetyltransferase CML1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml1Q9JIZ0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cml1Q9JIZ0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cml1Q9JIZ0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cml1Q9JIZ0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cml1Q9JIZ0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cml1Q9JIZ0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cml1Q9JIZ0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cml1Q9JIZ0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cml1Q9JIZ0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cml1Q9JIZ0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms