Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cxcl11Q9JHH5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms