Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a4aQ9ET37 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms