Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf13bQ9ET35 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf13bQ9ET35 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf13bQ9ET35 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf13bQ9ET35 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf13bQ9ET35 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf13bQ9ET35 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf13bQ9ET35 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf13bQ9ET35 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf13bQ9ET35 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf13bQ9ET35 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13bQ9ET35 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13bQ9ET35 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms