Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Clstn2Q9ER65 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Clstn2Q9ER65 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms