Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan4Q9DCK3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms