Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms