Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms