Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PsenenQ9CQR7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PsenenQ9CQR7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms