Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RetnQ99P87 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
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