Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac9Q99N13 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms