Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GatbQ99JT1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GatbQ99JT1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GatbQ99JT1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GatbQ99JT1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GatbQ99JT1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GatbQ99JT1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GatbQ99JT1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GatbQ99JT1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms