Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CsprsQ99388 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CsprsQ99388 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CsprsQ99388 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CsprsQ99388 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CsprsQ99388 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CsprsQ99388 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CsprsQ99388 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CsprsQ99388 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CsprsQ99388 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CsprsQ99388 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CsprsQ99388 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CsprsQ99388 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CsprsQ99388 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CsprsQ99388 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CsprsQ99388 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CsprsQ99388 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CsprsQ99388 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CsprsQ99388 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CsprsQ99388 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms