Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrp1bQ91YK2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms