Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCX6

Kptn, KICSTOR complex protein kaptin, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KptnQ8VCX6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KptnQ8VCX6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KptnQ8VCX6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KptnQ8VCX6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KptnQ8VCX6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KptnQ8VCX6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KptnQ8VCX6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms