Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc9Q8VC31 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc9Q8VC31 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms