Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpf1Q8CFE2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms