Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms