Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot2Q8C5L3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms