Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctdsp2Q8BX07 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms