Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Pggt1bQ8BUY9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Pggt1bQ8BUY9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
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Pggt1bQ8BUY9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Pggt1bQ8BUY9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pggt1bQ8BUY9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Pggt1bQ8BUY9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Pggt1bQ8BUY9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Pggt1bQ8BUY9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Pggt1bQ8BUY9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Pggt1bQ8BUY9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Pggt1bQ8BUY9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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