Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnpo1Q8BFY9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms