Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF4

Sdccag8, Serologically defined colon cancer antigen 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag8Q80UF4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sdccag8Q80UF4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdccag8Q80UF4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms