Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPL9

Ddx55, ATP-dependent RNA helicase DDX55, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx55Q6ZPL9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx55Q6ZPL9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx55Q6ZPL9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx55Q6ZPL9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms