Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Supt6hQ62383 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Supt6hQ62383 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Supt6hQ62383 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Supt6hQ62383 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Supt6hQ62383 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.6 ms