Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx3xQ62167 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx3xQ62167 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx3xQ62167 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx3xQ62167 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx3xQ62167 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx3xQ62167 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx3xQ62167 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx3xQ62167 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms