Protein–RNA interactions for Protein: Q61772

Epha7, Ephrin type-A receptor 7, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha7Q61772 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Epha7Q61772 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Epha7Q61772 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Epha7Q61772 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms