Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Itga7Q61738 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga7Q61738 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga7Q61738 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga7Q61738 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga7Q61738 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga7Q61738 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga7Q61738 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga7Q61738 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga7Q61738 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga7Q61738 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga7Q61738 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga7Q61738 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga7Q61738 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga7Q61738 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga7Q61738 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga7Q61738 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga7Q61738 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga7Q61738 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga7Q61738 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga7Q61738 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga7Q61738 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms