Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc42Q5SV66 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms