Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms