Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slfn4Q3UV66 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slfn4Q3UV66 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms