Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Skap2Q3UND0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms