Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULF4

Spg7, Paraplegin, mousemouse

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg7Q3ULF4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Spg7Q3ULF4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spg7Q3ULF4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spg7Q3ULF4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms