Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp36Q3UFY0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms