Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp39Q02525 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms