Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RykQ01887 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RykQ01887 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RykQ01887 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RykQ01887 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RykQ01887 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RykQ01887 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RykQ01887 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RykQ01887 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RykQ01887 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RykQ01887 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RykQ01887 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RykQ01887 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RykQ01887 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RykQ01887 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RykQ01887 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RykQ01887 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RykQ01887 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RykQ01887 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RykQ01887 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RykQ01887 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RykQ01887 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RykQ01887 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RykQ01887 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RykQ01887 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RykQ01887 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RykQ01887 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RykQ01887 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RykQ01887 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RykQ01887 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RykQ01887 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RykQ01887 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RykQ01887 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RykQ01887 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RykQ01887 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RykQ01887 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RykQ01887 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RykQ01887 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RykQ01887 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RykQ01887 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RykQ01887 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RykQ01887 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RykQ01887 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RykQ01887 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RykQ01887 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RykQ01887 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RykQ01887 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RykQ01887 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RykQ01887 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RykQ01887 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RykQ01887 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RykQ01887 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RykQ01887 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RykQ01887 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RykQ01887 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RykQ01887 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RykQ01887 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RykQ01887 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RykQ01887 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RykQ01887 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RykQ01887 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RykQ01887 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RykQ01887 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RykQ01887 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RykQ01887 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RykQ01887 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RykQ01887 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RykQ01887 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RykQ01887 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RykQ01887 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RykQ01887 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RykQ01887 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RykQ01887 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RykQ01887 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RykQ01887 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RykQ01887 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RykQ01887 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RykQ01887 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RykQ01887 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RykQ01887 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RykQ01887 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms