Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabpb1Q00420 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms