Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4bP68372 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4bP68372 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms