Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CirbpP60824 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CirbpP60824 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CirbpP60824 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CirbpP60824 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CirbpP60824 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CirbpP60824 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CirbpP60824 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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