Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a1P55014 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a1P55014 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc12a1P55014 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc12a1P55014 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc12a1P55014 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc12a1P55014 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc12a1P55014 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms