Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa8P50706 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa8P50706 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa8P50706 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa8P50706 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms