Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cav1P49817 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cav1P49817 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cav1P49817 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cav1P49817 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cav1P49817 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cav1P49817 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cav1P49817 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cav1P49817 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cav1P49817 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cav1P49817 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cav1P49817 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms