Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11bP46638 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11bP46638 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms