Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms