Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VhlP40338 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VhlP40338 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VhlP40338 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VhlP40338 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VhlP40338 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VhlP40338 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VhlP40338 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VhlP40338 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VhlP40338 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VhlP40338 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VhlP40338 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VhlP40338 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VhlP40338 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VhlP40338 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VhlP40338 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VhlP40338 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VhlP40338 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VhlP40338 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VhlP40338 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VhlP40338 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VhlP40338 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VhlP40338 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VhlP40338 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VhlP40338 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VhlP40338 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VhlP40338 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VhlP40338 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VhlP40338 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VhlP40338 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VhlP40338 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VhlP40338 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VhlP40338 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VhlP40338 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VhlP40338 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VhlP40338 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VhlP40338 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VhlP40338 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VhlP40338 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VhlP40338 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VhlP40338 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VhlP40338 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VhlP40338 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VhlP40338 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VhlP40338 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VhlP40338 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VhlP40338 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VhlP40338 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VhlP40338 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VhlP40338 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VhlP40338 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VhlP40338 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VhlP40338 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VhlP40338 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VhlP40338 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VhlP40338 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VhlP40338 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VhlP40338 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VhlP40338 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VhlP40338 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VhlP40338 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VhlP40338 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VhlP40338 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VhlP40338 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VhlP40338 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VhlP40338 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VhlP40338 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VhlP40338 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VhlP40338 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VhlP40338 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VhlP40338 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VhlP40338 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VhlP40338 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VhlP40338 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VhlP40338 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VhlP40338 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VhlP40338 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VhlP40338 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VhlP40338 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VhlP40338 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VhlP40338 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VhlP40338 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VhlP40338 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VhlP40338 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VhlP40338 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VhlP40338 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VhlP40338 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VhlP40338 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VhlP40338 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VhlP40338 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VhlP40338 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VhlP40338 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VhlP40338 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VhlP40338 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VhlP40338 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VhlP40338 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VhlP40338 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VhlP40338 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VhlP40338 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VhlP40338 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms