Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGCXP38435 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGCXP38435 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGCXP38435 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGCXP38435 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGCXP38435 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGCXP38435 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGCXP38435 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGCXP38435 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGCXP38435 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGCXP38435 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGCXP38435 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGCXP38435 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGCXP38435 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGCXP38435 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGCXP38435 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGCXP38435 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGCXP38435 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGCXP38435 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GGCXP38435 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGCXP38435 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGCXP38435 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGCXP38435 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGCXP38435 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GGCXP38435 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGCXP38435 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GGCXP38435 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGCXP38435 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGCXP38435 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGCXP38435 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGCXP38435 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGCXP38435 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGCXP38435 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGCXP38435 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GGCXP38435 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGCXP38435 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGCXP38435 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGCXP38435 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGCXP38435 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGCXP38435 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGCXP38435 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGCXP38435 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGCXP38435 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGCXP38435 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GGCXP38435 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGCXP38435 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGCXP38435 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGCXP38435 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGCXP38435 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGCXP38435 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGCXP38435 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGCXP38435 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGCXP38435 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGCXP38435 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGCXP38435 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGCXP38435 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGCXP38435 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGCXP38435 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGCXP38435 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGCXP38435 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGCXP38435 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGCXP38435 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGCXP38435 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGCXP38435 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GGCXP38435 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGCXP38435 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGCXP38435 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGCXP38435 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GGCXP38435 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGCXP38435 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGCXP38435 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGCXP38435 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GGCXP38435 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGCXP38435 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGCXP38435 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGCXP38435 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGCXP38435 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGCXP38435 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGCXP38435 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGCXP38435 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGCXP38435 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGCXP38435 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGCXP38435 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGCXP38435 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGCXP38435 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGCXP38435 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GGCXP38435 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGCXP38435 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGCXP38435 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGCXP38435 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGCXP38435 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGCXP38435 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGCXP38435 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGCXP38435 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGCXP38435 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGCXP38435 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGCXP38435 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGCXP38435 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGCXP38435 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGCXP38435 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms