Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja4P28235 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja4P28235 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja4P28235 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja4P28235 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja4P28235 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja4P28235 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja4P28235 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja4P28235 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja4P28235 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja4P28235 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja4P28235 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja4P28235 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja4P28235 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gja4P28235 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja4P28235 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja4P28235 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja4P28235 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja4P28235 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja4P28235 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja4P28235 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja4P28235 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja4P28235 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja4P28235 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja4P28235 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja4P28235 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms